Características básicas
Células con núcleo rodeado de membrana.
Nombres alternativos
Eukaryota, Eukarya.
Grupos incluidos
Los organismos (todos) han sido subdivididos de muy diversas maneras. Animales y Vegetales fue quizá la primera de esas subdivisiones. Ese primer esquema taxonómico vino a trastocarse cuando se descubrió la vida microbiana.
Dos hitos deben ser considerados para explicar la situación actual. Por un lado, la aceptación del hecho evolutivo y de la teoría del origen común, por otro, los avances en el estudio de la ultraestructura celular y la genética.
Ya en el siglo XX se llegó a la subdivisión procariota/eucariota como la segregación de mayor amplitud concebible en el mundo orgánico actual. Como el lector podrá deducir, esta segregación sigue vigente en la actualidad.
En la 2ª mitad del siglo XX se llegó a un cierto consenso con el llamado sistema de los cinco reinos. Uno de esos reinos (monera) correspondía a los procariotas. Los otros cuatro reinos estaban formados por eucariotas:
Como la idea de agrupar por el simple hecho de la unicelularidad no parecía acorde con las ideas evolutivas, el sistema anterior sufrió una modificación:
El reino Protoctista agrupaba no sólo a los eucariotas unicelulares sino también a formas multicelulares estrechamente relacionadas con ellos. Ésta era la situación cuando irrumpen hacia finales del siglo XX los estudios de filogenia molecular.
Estructura filogenética
La filogenia molecular ha producido un cambio sustancial en la clasificación en grandes grupos de los eucariotas.
El antiguo reino eucariota, Protista (eucariotas unicelulares), y su versión ampliada, Protoctista (eucariotas unicelulares y sus descendientes multicelulares inmediatos), se han visto desintegrados en seis supergrupos:
Los otros tres antiguos reinos eucariotas (plantas, animales y hongos) sí mantienen a grandes rasgos su integridad. Todas las plantas (Plantae) quedan incluidas en el supergrupo Archaeplastida. Los hongos (Fungi) y los animales (Metazoa) quedan incluidos en el supergrupo Opisthokonta.
Este esquema taxonómico es el resultado de la actualización de otro más antiguo integrado por los grupos Amoebozoa, Opisthokonta, Excavata, Rhizaria, Chromalveolata (Stramenopiles + Alveolados + Haptophyta + Cryptophyta) y Archaeplastida.
Debemos tener en cuenta que la filogenia molecular de los eucariotas debe recorrer aún un largo camino. La muestra de especies deberá ser ampliada así como el número de secuencias estudiadas. Muchos géneros (más de 200) de protistas no tienen aún una posición taxonómica clara.
Amoebozoa y Opisthokonta aparecen a menudo reunidos en un clado llamado Unikonta. Los cuatro restantes taxones formarían el clado Bikonta. No obstante, esta bifurcación no siempre se ve confirmada.
Imágenes
Amoeba proteus (Amoebozoa)
Fuente: Microscopy-UK (http://www.microscopy-uk.org.uk/)
Abajo: Saccharomyces cerevisiae (Opisthokonta)
Fuente: Academy of Sciences of the Czech Republic (http://www.biomed.cas.cz/)
Abajo: Euglena gracilis (Excavata)
Fuente: The Virtual Biology Labs (http://bio.rutgers.edu/)
Abajo: Haplosporidium nelsoni (Grupo SAR)
Fuente: Haplosporidia (http://research.amnh.org/users/siddall/haplosporidia/haplo.html)
Abajo: Calcidiscus leptoporus (Hacrobia)
Fuente: Isao Inouye/Phycological Images (http://www.biol.tsukuba.ac.jp/~inouye/ino/phycological_images.html)
Abajo: Volvox carteri (Archaeplastida)
Fuente: University of Cambridge, DAMTP: Goldstein Lab (http://www.damtp.cam.ac.uk/user/gold/movies.html)
Página actualizada el 27-XI-2009.
Características básicas
Supergrupo que emerge de los estudios de filogenia molecular y que aparece constituido por formas ameboides de diversos tipos. Téngase en cuenta que organismos ameboides se encuentran también en varios de los otros supergrupos.
Sinapomorfías conocidas: ninguna.
Grupos incluidos
Estructura filogenética
Algunos clados de Amoebozoa que reciben suficiente soporte en diferentes análisis son los siguientes:
Las relaciones de proximidad entre los clados citados no están claras todavía. Los cuatro últimos clados se suelen agrupar bajo la denominación Conosea (Conosa) y los tres últimos bajo la denominación Eumycetozoa.
Entre los Amoebozoa de posición incierta están: Filamoeba, Gephyramoeba, Trichosphaerium, Phalansterium, Multicilia y otros.
Imágenes
Amoeba (Amoebozoa: Tubulinea)
Fuente: Microscopy-UK (http://www.microscopy-uk.org.uk/)
Abajo: Mayorella (Amoebozoa: Flabellinea)
Fuente: The Amoebae/The University of Edinburgh (http://www.bms.ed.ac.uk/research/others/smaciver/mayorella.htm)
Abajo: Acanthamoeba (Amoebozoa: Acanthamoebidae)
Fuente: Homepage of Dr. Simon Kilvington (http://www.le.ac.uk/iii/staff/sk46.html)
Abajo: Pelomyxa (Amoebozoa: Archamoeba)
Fuente: Microscopy-UK (http://www.microscopy-uk.org.uk/)
Abajo: Comatricha (Amoebozoa: Myxogastria)
Fuente: Tom Volk's Fungi Collection (http://botit.botany.wisc.edu/images/332/Slime_molds_M_Ac_sl_so/)
Abajo: Dictyostelium (Amoebozoa: Dictyostelia)
Fuente: Richard H. Kessin, "Evolutionary biology: Cooperation can be dangerous", Nature 408, 917-919 (21 December 2000) (http://www.nature.com/nature/journal/v408/n6815/fig_tab/408917a0_F1.html...)
(Si pulsa en el enlace anterior accederá a la leyenda de la imagen).
Abajo: Ceratiomyxa (Amoebozoa: Protostelia)
Fuente: J.K. Lindsey/The Ecology of Commanster (http://popgen.unimaas.nl/~jlindsey/commanster/Mushrooms/Protozoa/Protozo...)
Características básicas
Los primeros datos respaldando la monofilia de este supergrupo provienen de análisis filogenéticos moleculares del genoma plastidial. Los análisis con genes nucleares apoyaban sólo moderadamente dicha hipótesis.
El estudio de Rodríguez-Ezpeleta (Current Biology, Vol. 15, 1325–1330, July 26, 2005) usando 50 genes plastidiales y 130 genes nucleares da, al parecer, por zanjadas las dudas acerca de la monofilia de este supergrupo.
Sinapomorfías conocidas: ninguna.
Una hipótesis subyacente a esta agrupación es que sus plástidos derivan de una endosimbiosis primaria ancestral con una cianobacteria. De acuerdo con esto, los miembros ancestrales de este supergrupo fueron los primeros eucariotas fotosintéticos.
Nombres alternativos
Plantae (Cavalier-Smith), Primoplantae (Palmer et al.).
Adoptamos aquí la denominación propuesta en 2005 por Adl et al. (Archaeplastida) por dos razones: a) el término Plantae ha sido usado desde el siglo XIX para describir agrupaciones muy diferentes de organismos fotosintéticos, por lo que seguir usándolo puede constituir una fuente de confusión. b) el término Archaeplastida hace cierta referencia a la hipótesis que subyace a esta agrupación (ver apartado anterior).
Grupos incluidos
Estructura filogenética
Imágenes
Glaucocystis (Archaeplastida: Biliphyta: Glaucophyta)
Fuente: Image Gallery of Freshwater Algae/Jason K. Oyadomari (http://www.keweenawalgae.mtu.edu/index.htm)
Abajo: Plocamium coccineum (Archaeplastida: Biliphyta: Rhodophyceae)
Fuente: Imágenes herbario consulta/Universidad de Navarra (http://www.unav.es/botanica/bpnvasc/imagenes/default.html)
Abajo: Codium bursa (Archaeplastida: Chloroplastida)
Fuente: Herbario virtual de la Universidad de Alicante (http://www.herbariovirtual.ua.es/consultas.htm)
Características básicas
Dos características morfológicas sirvieron para agrupar cinco tipos de flagelados heterotrofos bajo el nombre de "excavados": la presencia de un surco ventral longitudinal alimenticio y una determinada organización del aparato flagelar proximal. Más tarde, el grupo se expandió con otros tres tipos de protistas que no cumplían esas dos características a la vez.
Cuando la monofilia del grupo fue puesta a prueba por análisis moleculares, los primeros resultados fueron algo incoherentes. Algunos excavados "típicos" (Malawimonas) no aparecían agrupados con los demás, mientras que otros protistas "no excavados" tales como Euglenozoa (Euglena, Trypanosoma) y Parabasalia (Trichomonas) aparecían agrupados con los excavados. Esto implicó una nueva expansión pero a la vez creó una sombra de duda sobre la validez del grupo.
Recientemente (Rodríguez-Ezpeleta et al., 2007) ha sido descrita una sinapomorfía: una corta inserción de aminoácidos en una de las proteínas (RpI24A) de la subunidad ribosómica grande, que al parecer sólo se halla en una parte de los excavados.
Grupos incluidos
Estructura filogenética
Imágenes
Excavata - Los diez tipos (pulsar sobre la imagen para ampliar)
Fuente: Simpson, A.G.B., Cytoskeletal organization, phylogenetic affinities and systematics in the contentious taxon Excavata (Eukaryota), International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 53, 1759–1777, 2003.
Abajo: Inserción en Rpl24A (pulsar sobre la imagen para ampliar)
Fuente: Rodríguez-Ezpeleta, N. et al., Toward Resolving the Eukaryotic Tree: The Phylogenetic Positions of Jakobids and Cercozoans, Current Biology, 17, 1420–1425, August 21, 2007.
Abajo: Trypanosoma (Excavata: Discoba: Euglenozoa)
Fuente: Centers for Disease Control and Prevention/Dr. Myron G. Schultz (http://phil.cdc.gov/PHIL_Images/03122002/00002/PHIL_613_lores.jpg)

Abajo: Malawimonas (Excavata)
Fuente: Microscope/American Type Culture Collection/D.J. Patterson, L Amaral-Zettler, M. Peglar and T. Nerad (http://starcentral.mbl.edu/microscope/portal.php?pagetitle=assetfactshee...)
Abajo: Oxymonas (Excavata: Preaxostyla)
Fuente: Microscope/Drawings by Guy Brugerolle (http://starcentral.mbl.edu/microscope/portal.php?pagetitle=collectiondet...)
Abajo: Giardia lamblia (Excavata: Fornicata: Diplomonada)
Fuente: Centers for Disease Control and Prevention/Janice Carr (http://phil.cdc.gov/PHIL_Images/8698/8698_lores.jpg)
Abajo: Trichonympha (Excavata: Parabasalia)
Fuente: Taxa of Life/J. Holt & C. Iudica (http://comenius.susqu.edu/bi/202/EXCAVATA/EUEXCAVATAE/parabasala.htm)
Características básicas
Agrupación que se apoya en datos de filogenia molecular, tanto de genes nucleares como de genes plastidiales.
El plástido fue adquirido mediante endosimbiosis secundaria con un alga roja.
Algunos miembros del clado (Cryptophyceae) han retenido dos caracteres ancestrales: un nucleomorfo (el núcleo relíctico del alga roja endosimbionte) y ficobilinas (pigmentos fotosintéticos accesorios presentes en las algas rojas). Ninguno de los otros miembros de este clado presenta esos caracteres, ni en conjunto ni por separado.
Grupos incluidos
Candidatos:
Nota: Goniomonas, Telonema, Kathablepharidae y Centrohelida carecen de plástido.
Estructura filogenética
No hay datos definitivos, pero Kathablepharidae parecen estar próximos a Cryptophyceae.
Imágenes
Calcidiscus leptoporus (Hacrobia: Haptophyceae)
Fuente: Isao Inouye/Phycological Images (http://www.biol.tsukuba.ac.jp/~inouye/ino/phycological_images.html)
Abajo: Cryptomonas (Hacrobia: Cryptophyceae)
Fuente: Tree of Life Project/Kerstin Hoef-Emden (http://tolweb.org/Cryptomonas/97214)

Abajo: Telonema (Hacrobia)
Fuente: Tree of Life Project/Copyright © Kamran Shalchian-Tabrizi (http://tolweb.org/images/Hacrobia/124797)
Esta imagen aparece aquí para uso exclusivamente didáctico.

Abajo: Kathablepharis (Hacrobia: Kathablepharidae)
Fuente: Tree of Life Project/Copyright © Angelika Preisfeld and D.J. Patterson (http://tolweb.org/Katablepharids/2413)

Abajo: Raphidiophrys (Hacrobia: Centrohelida)
Fuente: Micro*scope/Copyright: Martin Kreutz (http://starcentral.mbl.edu/microscope/portal.php?pagetitle=assetfactshee...)

Características básicas
Inserción de unos 12 aminoácidos de longitud en la proteína EF-1α.
(Este carácter constituye, al parecer, la única sinapomorfía conocida que une a todos los miembros de este taxón y los diferencia de todos los demás eucariotas).
Grupos incluidos
Estructura filogenética
Los protistas citados en el último punto del apartado anterior fueron reunidos en un grupo (phylum Choanozoa) por Cavalier-Smith. De forma similar, Adl et al. reúnen a esos protistas (a excepción de Choanomonada) en un grupo llamado Mesomycetozoa.
Ahora bien, ni Choanozoa ni Mesomycetozoa son grupos monofiléticos. Los resultados experimentales más recientes muestran que esos protistas tienen afinidades ya sea con Fungi, ya sea con Metazoa.
Nuclearia aparece próximo a Fungi, el resto de los citados protistas muestra afinidades con Metazoa pero aún no hay consenso sobre el orden en que dichos protistas se derivan de la linea que lleva a Metazoa. La tendencia general es considerar a Choanomonada como el grupo más próximo a Metazoa.
Un esquema taxonómico provisional de Opisthokonta contemplaria dos subclados con la siguiente composición:
Imágenes
Inserción en la proteína EF-1α (pulsar sobre la imagen para ampliar)
Fuente: Steemkamp et al., "The Protistan Origins of Animals and Fungi", Mol. Biol. Evol. 23(1):93–106. 2006.
Abajo: Nuclearia (Opisthokonta: Holomycota)
Fuente: Wikipedia (http://ja.wikipedia.org/wiki/%E5%88%A9%E7%94%A8%E8%80%85:NEON/Images)
Abajo: Sphaeroeca (Opisthokonta: Holozoa: Choanomonada)
Fuente: Damián Zanette's Webpage (http://cabfst28.cnea.gov.ar/~zanette/)
Características básicas
Agrupación basada en estudios recientes (desde 2007 en adelante) de filogenia molecular.
Sinapomorfías conocidas: ninguna.
Grupos incluidos
Estructura filogenética
Los estudios realizados no permiten aún dilucidar cuál es el grupo basal.
Imágenes
Opalina (Grupo SAR: Stramenopiles)
Fuente: Protist Information Server/Y. Tsukii (http://protist.i.hosei.ac.jp/PDB/Images/Opalinata/Opalina.html)
Abajo: Paramecium (grupo SAR: Alveolata)
Fuente: Wikimedia Commons/User:Luis Fernández García (http://commons.wikimedia.org/wiki/Image:Paramecium.jpg)

Abajo: Haplosporidium nelsoni (Grupo SAR: Rhizaria)
Fuente: Haplosporidia (http://research.amnh.org/users/siddall/haplosporidia/haplo.html)
Página actualizada el 27-XI-2009
Características básicas
Grupo que emerge, avalado por datos moleculares, como una ampliación de Cercozoa, el cual se apoya también en datos moleculares.
La única sinapomorfía conocida en este supergrupo fue descubierta por Archibald et al. (2003). Se trata de una corta inserción (1 ó 2 aminoácidos) en la poliubiquitina. Este carácter se halla sólo en una parte de los rhizarianos (Cercozoa y Foraminifera), estando ausente en los otros rhizarianos y en los restantes eucariotas estudiados.
Grupos incluidos
Estructura filogenética
Teniendo en cuenta la sinapomorfía ya comentada, dos subclados pueden ser contemplados:
Imágenes
Inserción en la proteína poliubiquitina (pulsar sobre la imagen para ampliar)
Fuente: John M. Archibald et al., "A Novel Polyubiquitin Structure in Cercozoa and Foraminifera: Evidence for a New Eukaryotic Supergroup", Mol. Biol. Evol. 20(1):62–66. 2003.
Abajo: Gromia (Grupo SAR: Rhizaria: core Rhizaria)
Fuente: Protist Information Server (http://protist.i.hosei.ac.jp/)
Nota: Imagen usada aquí con fines exclusivamente educativos.
Abajo: Pleuraspis (Grupo SAR: Rhizaria: Radiolaria)
Fuente: Taxa of Life/Jack Holt & Carlos Iudica (http://comenius.susqu.edu/bi/202/Taxa.htm)